The effectiveness of position- and composition-specific gap costs for protein similarity searches
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
The effectiveness of position- and composition-specific gap costs for protein similarity searches
MOTIVATION The flexibility in gap cost enjoyed by hidden Markov models (HMMs) is expected to afford them better retrieval accuracy than position-specific scoring matrices (PSSMs). We attempt to quantify the effect of more general gap parameters by separately examining the influence of position- and composition-specific gap scores, as well as by comparing the retrieval accuracy of the PSSMs cons...
متن کاملon the relationship between different discourse markers and information-gap and reasoning-gap tasks, and the effectiveness of input enhancement type of instruction on students acquisition of discourse markers.
abstract tasks nowadays are at the center of attention in sla research. task types is one of the critical issues in this regard, their effectiveness and suitability to any particular context, their characteristics and the result they yield are among some of these issues. on the other hand, discourse markers (dms) have been very much investigated and their effectiveness in conveying the meaning...
15 صفحه اولRapid and sensitive protein similarity searches.
An algorithm was developed which facilitates the search for similarities between newly determined amino acid sequences and sequences already available in databases. Because of the algorithm's efficiency on many microcomputers, sensitive protein database searches may now become a routine procedure for molecular biologists. The method efficiently identifies regions of similar sequence and then sc...
متن کامل: the effect of sericin levels (silk glue protein) on rate of in vitro maturation, fertilization and culture of sheep oocytes
هدف از آزمایش اول بررسی اثر سطوح مختلف سریسین [0 (control), 0.1, 0.5, 1.0, 2.5 %] افزوده شده به محیط , ivm بر cumulus cell expansion، بلوغ هسته و توسعه متوالی جنین، در گوسفندان نژاد سنجابی در فصل تولید مثلی می باشد. از سرگیری میوز به وسیله خارج شدن اولین پولار بادی اندازه گیری و هم چنین درصد رسیدن جنین های دو سلولی به مرحله کلیواژ و بلاستوسیت نیز به عنوان نشانه ای از میزان شایستگی توسعه اولیه ج...
learners’ attitudes toward the effectiveness of mobile-assisted language learning (mall) in vocabulary acquisition in the iranian efl context: the case of word lists, audiobooks and dictionary use
رشد انفجاری تکنولوژی فرصت های آموزشی مهیج و جدیدی را پیش روی فراگیران و آموزش دهندگان گذاشته است. امروزه معلمان برای اینکه در امر آموزش زبان بروز باشند باید روش هایی را اتخاذ نمایند که درآن ها از تکنولوژی جهت کمک در یادگیری زبان دوم و چندم استفاده شده باشد. با در نظر گرفتن تحولاتی که رشته ی آموزش زبان در حال رخ دادن است هم اکنون زمان مناسبی برای ارزشیابی نگرش های موجود نسبت به تکنولوژی های جدید...
15 صفحه اولذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Bioinformatics
سال: 2008
ISSN: 1367-4803,1460-2059
DOI: 10.1093/bioinformatics/btn171